Το 1990 αποκτήθηκε από τον Παναθηναϊκό και αγωνίστηκε αμέσως στην Α' εθνική.
Προς το τέλος της καριέρας του άλλαζε διαδοχικά ομάδες (Καλαμάτα, Ιωνικός Νικαίας, Άρης, Προοδευτική), όμως αγωνίστηκε και στο Κυπριακό πρωτάθλημα με τη φανέλα της ΑΕΚ Λάρνακας.
Συνοπτικά σε 343 αγώνες του στην Α' εθνική της Ελλάδας πέτυχε 116 γκολ, ενώ αντίστοιχα στην Α' εθνική της Κύπρου πέτυχε 14 γκολ σε 20 αγώνες.
Τα τελευταία χρόνια ασχολείται με το ποδόσφαιρο από άλλες θέσεις. Την περίοδο 2007-08 διετέλεσε τεχνικός διευθυντής στην ομάδα του Ηλυσιακού, αλλά και υπηρεσιακός προπονητής της ομάδας προς το τέλος του πρωταθλήματος της Β' εθνικής.
Εκτελέσεις φάουλ
Ο Κώστας Φραντζέσκος υπήρξε ρέκορντμαν στις εκτελέσεις φάουλ στην Ελλάδα, εκτελώντας πάντα με το αριστερό πόδι που ήταν και το καλό του, γεγονός για το οποίο του αποδόθηκε το προσωνύμιο "μίστερ φάουλ". Είναι ο μοναδικός ποδοσφαιριστής στην ιστορία του ελληνικού ποδοσφαίρου που κατάφερε να πετύχει χατ τρικ (3 γκολ στον ίδιο αγώνα) από 3 εκτελέσεις φάουλ. Συνέβη σε αγώνα ΠΑΟΚ - Καστοριάς για την τελευταία αγωνιστική του πρωταθλήματος 1996-97 Αντίθετα δεν ήταν ιδιαίτερα εύστοχος στις εκτελέσεις πέναλτι.
Στην Εθνική Ελλάδας
Στην Εθνική ομάδα αγωνίστηκε σε 38 αγώνες και πέτυχε 7 γκολ. Η πρώτη του συμμετοχή έγινε στις 2 Σεπτεμβρίου 1992 σ' ένα φιλικό αγώνα με αντίπαλο την Εθνική Κύπρου(2-3) που είχε γίνει στο Καυτανζόγλειο. Προπονητής του ο Αλκέτας Παναγούλιας
πηγές